Packages R para Modelos mixtos

Título del curso: Packages R para Modelos mixtos

Impartido por: Josep A. Sanchez (Universitat Politècnica de Catalunya)

Idioma
del curso: Español

Fechas y
horarios del curso: 16, 17, 18 de junio, de 9 a 13 h, día 19 de junio de 9 a 12 h


Lugar: aula PC2

Tipo d'actividad y carga lectiva: Curso de 15 horas

Descripción:

Este curso se centra en conocer los métodos y resultados de los principales paquetes de R que trabajan con Modelos Mixtos. Se pone especial énfasis en la aplicación e interpretación de los modelos.


Programa:

  1. Teoría introductoria de Modelos mixtos
  • Especificación de modelos
  • Estimación (enfoque frecuentista y bayesiano)
  • Inferencia y predicción
  • Diagnóstico
  • Modelos Mixtos Lineales (nlme package)
    • Extensiones: estructura en las matrices de covarianzas de efectos aleatorios (pdMat) y residuos varFunc y corStruct)
  • Modelos Mixtos No Lineales (nlme package)
    • Familias paramétricas con auto-arranque (selfStart)
  • Modelos Mixtos Lineales Generalizados (lme4 package)
    • Respuesta binària y recuentos
  • Otros paquetes de modelos mixtos:
    • glmmADMB package: modelos mixtos generalizados para recuentos con sobredispersión (poisson, binomial negativa e infladas por zero, ZIP y ZINB)
    • MCMCglmm package: métodos bayesianos (MCMC) para modelos mixtos generalizados
    • Extensiones en R para estimación, inferencia (lmerTest y pbkrtest) y diagnostico con modelos mixtos (influenceME)

    Referencias:

    • Pinheiro, J.C. and Bates, D.M. (2000). Mixed-Effects Models in S and S-PLUS. New York: Springer.
    • Zuur, A.F. et al. (2009). Mixed effects models and extensions in ecology with R. New York: Springer.
    • Gelman A. and Hill J. (2006) Data analysis using regression and multilevel/hierarchical models: Cambridge


    Evaluación:

    Resolución de un caso práctico propuesto al final del curso